【深圳商报讯】(首席记者袁静娴)近日,全球首个10万规模鸡参考面板项目——100K GCRP(Global Chicken Reference Panel)研究第一阶段成果,在《Genomics, Proteomics&Bioinformatics》杂志在线发表。由中国农业大学胡晓湘教授和王宇哲团队牵头的研究团队,构建了全球首个鸡类参考基因组资源库,有望为鸡种遗传变异图谱构建、人工选择研究和精准育种提供基础支撑。
记者了解到,在此研究中,深圳企业华大智造的DNBSEQ-T7基因测序平台以及MGISP-960高通量自动化样本制备系统、MGISTP-7000分杯处理系统为项目组提供了从样本处理到基因测序的系统支持。
胡晓湘教授表示,“从AI大模型的角度来说,基因组也是一门语言,它本身就非常符合文本类型语言化的特征。把鸡的基因组弄明白后,对我们理解人类和其他动物的疾病等现象都是有帮助的,这是我们全球鸡基因字典这个项目希望实现的意义。”
在研究中,研究团队采用低深度测序获得了10104份商品鸡样本,此外搜集了1847个高深度测序样本,构建了两个高质量子面板,系统评估了不同策略下的基因型填充性能,并在模拟与真实性状中展示了其在GWAS和因果变异定位中的优势。该资源库有望为鸡种遗传变异图谱构建、人工选择研究和精准育种提供基础支撑。
(文章来源:深圳商报)
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原标题:鸡也有了“基因字典” 华大智造助力全球首个鸡参考面板成果发布